Se trata de la mejor formación de Loro (Prunus lusitanica L. subsp. Iusitanica) de España. Esta especie relicta del Terciario se encuentra de manera muy dispersa por gran parte de la Península Ibérica, teniendo esta zona por tanto un elevado valor.
La zona a proteger corresponde a la banda de 5 m situada a cada margen de la Garganta de la Trucha (zona de dominio público hidráulico) desde el punto 30SUJ070803, que corresponde con la desembocadura del arroyo del molino en la Garganta de la Trucha, hasta los puntos 30SUJ067799 y 30SUJ068799 situados aguas arriba del punto anterior, y que se sitúan en dos arroyos de cabecera de la Garganta de la Trucha.
Como el resto de las Villuercas, Alía y su término alberga multitud de aves en peligro de extinción, buites, águilas y otras muchas. En los riscos de las montañas o en las riberas de los ríos, además es paso estacional para otras como las grullas, que llenan el cielo entre enero y marzo.
La ZEPA de Villuercas e Ibores ( Decreto 232/2000) , linda con otros espacios protegidos como la ZEPA de Puerto Peña-Sierra de los Golondrinos. y la Reserva Regional de Caza de Cijara etc..
El río Guadalupejo, desde su nacimiento, a la altura de Guadalupe,
hasta su desembocadura, en el embalse de la Central Nuclear de
Valdecaballeros, posee unos valores naturales de notable importancia
desde el punto de vista ecológico y paisajístico. Es de destacar
el perfecto estado de conservación del tramo alto y bajo del río,
en los que podemos encontrar formaciones vegetales de gran
importancia, como pueden ser, entre otras, las galerías ribereñas
termomediterráneas, los bosques galería de Salix alba y Populus
alba, los bosques de fresnos, los bosques alubiales residuales (Alnus
glutinosa) y los prados mediterráneos de hierbas altas y juncos.
También son importantes las formaciones vegetales asociadas a sus
márgenes, como: Pastizales de gramíneas y anuales, y bosques
mixtos de Quercus ilex y Quercus suber. Dentro del apartado
faunístico, cuenta con gran cantidad de especies, entre las que
podemos destacar: Nutria, Musaraña, Gato Montés, Garduña, Cigüeña
Negra, Buho Real, Autillo, Águila Calzada, Águila Culebrera, Milano
Real y Común, Elanio Azul, Azor, Gavilán, Cernícalo Primilla, así
como gran cantidad de aves acuáticas, como el Somormujo Lavanco,
Cormorán Grande, Zampullín Chico, Cigüeñuelas, Chorlito Gris,
Chorlitejo Chico y un largo etcétera. En el apartado piscícola podemos
destacar la abundancia de Pardillas y Cachuelos.